抗体片段的纯化策略
抗体片段,例如Fab、scFv、Dab、纳米抗体等已经成为抗体药物中非常重要的种类,由于其尺寸较小,更容易穿透组织,可以在疾病的诊断和治疗中发挥独特的作用。有Fc片段的单抗和双抗已经有成熟的纯化平台工艺,大大提高了工艺开发效率。针对抗体片段类型的分子,我们同样也可以建立平台化的纯化策略(见图1),帮助加速药物的开发进程。
图1:抗体片段分子的纯化平台
下面我们介绍一个Fab片段纯化的经典案例供大家参考。该抗体片段的基本性质见下表。
来源 | 大肠杆菌上清液 | ||||||
分子量 | 48kDa | ||||||
等电点 | 8.5 | ||||||
聚集体含量 | 3.5% |
根据抗体纯化的经典三步法策略,我们也将其纯化工艺分为捕获 (Capture) 、中间纯化 (Intermediate Purification) 、精纯 (Polishing) 三个步骤。每个阶段,都是分辨率、载量和回收率之间的一种平衡。
01
捕获阶段
在含有Fc片段的抗体纯化中,我们一般选择蛋白A填料来做捕获。那针对没有Fc的抗体片段,可以选择其他的亲和填料,如Mabselect VL(蛋白L)、Protein G Sepharose4FF(蛋白G)、Mabselect VH3(改造后的蛋白A)等等。想要了解各种亲和填料的特点请戳? 抗体亲和填料大赏 | 你“种草”了哪一款
02
中间纯化阶段
对于第二步的纯化,选择了Capto SP ImpRes这一款具有高分辨的阳离子填料,希望可以有效地去除聚集体。该案例使用了DoE的方式,寻找回收率和聚集体去除的最佳区间。使用上样pH、上样量和线性梯度长度为Factor;其他参数,如保留时间、Wash长度、梯度终点的氯化钠浓度等保持一致,选取优化阶段的CCC响应曲面设计进行实验,结果如图2、图3所示。
图2:回收率的响应曲面图
图3:聚集体的响应曲面图
根据图中显示的结果,在高pH的情况下回收率是比较好;但是对于聚集体的去除,低pH的效果更为显著且与上样量的多少并没有关系。为了寻找到回收率和聚集体去除都满足的空间,我们使用了甜蜜点 (sweet spot) 分析(梯度长度固定为20CV)。在绿色区域范围内,是可以同时满足回收率>90%并且聚集体含量≤1%的条件,而蓝色区域只能满足这其中之一。最后,在绿色区域中,选择上样量50 mg/mL,pH5的单点做验证,结果如图中所示,满足了该步骤对于质量的要求。
图4:梯度长度为20CV下的甜蜜点图
当然,在该案例中,我们使用了Capto SP ImpRes这款填料,如果在工艺中,纯阳离子填料无法满足要求的话,也可以考虑Capto MMC ImpRes这种复合模式的阳离子填料或者高分辨率的疏水填料Capto Phenyl ImpRes或Capto Butyl ImpRes,对产品相关杂质的去除也会有很好的效果。
03
精纯阶段
在第三步层析中,我们选择了Capto Q这一经典的阴离子纯化填料,对于这类等电点比较高的分子,用流穿模式可以很好地降低杂质水平。依然使用DoE的实验方式,选择上样量、上样PH和保留时间为Factor,回收率和ECP的水平作为Response,选取CCC响应曲面设计进行实验。
图5:使用Capto Q纯化的回收率和ECP去除的响应曲面图
据上图的结果,影响回收率的唯一因素就是上样量,上样量越高,回收率就越高;影响ECP去除的唯一因素是pH,pH越高,ECP的去除效率越高。该步骤中,在pH7.0-7.9的范围内,ECP可降低1.2-1.45倍。
同样地,在该步层析工艺中,除了Capto Q阴离子层析填料外,我们同样可以选择Capto Adhere或者Capto Adhere ImpRes这种复合模式的阴离子层析填料,开发思路和Capto Q一致,也会帮助解决一些Capto Q无法解决的疑难杂症。
在该案例中,三步工艺的回收率为80%以上,聚集体的含量从3.3%降低到了0.8%,ECP的含量从初始料液的400,000 ppm降低到了6 ppm,成功地创建了一个Fab的纯化工艺平台。
总结
综上所述,要建立抗体片段的纯化策略,其基本原理和我们纯化单抗类似,采用CIPP的策略,捕获步骤根据不同的结合位点选择不同的亲和填料;中间纯化可以使用高分辨的阳离子填料走结合洗脱模式,如Capto SP ImpRes 、复合模式的阳离子填料Capto MMC ImpRes或高分辨率的疏水填料Capto Phenyl ImpRes、Capto Butyl ImpRes;在最后的精纯步骤,就可以选择经典的阴离子填料走流穿模式,如Capto Q或者复合模式的阴离子填料如Capto Adhere以及Capto Adhere ImpRes。掌握以上三步,抗体片段纯化,手到擒来!
高效抗体工艺开发
双抗的纯化工艺开发策略
相关阅读:
? 抗体亲和填料大赏 | 你“种草”了哪一款?
参考文献:
Application note 29-0320-66 AA. A platform approach for the purification of antibody fragments (Fabs). .
Application note 29-0655-41 AB. A platform approach for the purification of domain antibodies (Dabs). .
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