蛋白层析前样品处理中的考量点 | 过滤篇
通过组合使用澄清过滤技术,可以有效地去除粗提取样品中的颗粒和大分子,从而获得更纯净的蛋白质样品,为后续的实验和分析提供可靠的基础。离心和过滤是实验室中对粗提液进行澄清的常用方法,一般离心或/和过滤后要尽快进行色谱层析纯化。离心可以用于除去大多数颗粒物质。对于小体积蛋白样品,可以采用10000-15000 g离心15 min。
如果离心后样品仍然不澄清,通常使用滤器过滤。一般,对于滤器的选择主要考虑以下三个方面:
孔径大小;
滤膜材质;
膜面积。
01
考虑滤膜孔径
滤膜孔径的选择取决于应用,常见应用的膜孔径选择如下:
如果是层析样品的过滤膜孔径选择,还要参照色谱层析填料的尺寸:
为什么层析前通常要对样品进行0.45 μm或0.22 μm的精密过滤呢?
举例,如果一个柱填料的直径是3 μm,那么流体通路(填料之间的空间)将是0.43 μm,因此需要一个0.2 μm的过滤器来防止颗粒堵塞柱子。 我们可以把层析柱想象成一个装满乒乓球的大管子,球之间的空间被称为“流体通路”。如果颗粒阻塞了柱中的流体通路,将会导致不准确的实验结果。此外,层析柱堵塞时柱压将升高,会减损柱子的使用寿命。因此,有效的过滤可以防止颗粒污染阻塞色谱柱内的流体通路,延长柱的寿命,并确保准确的结果。
02
考虑滤膜材质
滤膜材质的选择,要同时考虑到样品特性和溶剂的化学耐受性。
针对含蛋白样品的滤膜,推荐使用低蛋白吸附的滤膜:RC膜、PES膜、改良后的PVDF膜、CA膜。NC和尼龙膜具有较高的蛋白吸附性,不适合蛋白回收应用。
另外,滤膜的选择,也要考虑膜材的化学耐受性。特定化学溶剂可能会造成滤膜上纤维或颗粒的脱落,或产生溶出,从而影响过滤效果。
针对高颗粒含量的样品,普通的单层滤膜容易发生堵塞,此时可以考虑多步过滤。比如先用孔径在0.45 μm以上的滤器用来去除大的颗粒,再使用0.22 μm的滤器降低微生物总量。或者使用带有预滤层的滤器。常见的预滤膜介质,包括玻璃微纤维、聚丙烯等。比如Whatman GD/X针头滤器,内置玻璃微纤维滤纸-GMF150,GMF150是一种多层预滤膜介质,从上至下滤纸孔径依次减小,起到梯度过滤的效果,比没有加预滤介质的滤膜相比,过滤量高达3-7倍,相对于单层的预滤介质,拥有近2倍的过滤量。
03
考虑有效过滤面积 (EFA)
有效过滤面积 (EFA, Effective Filtering Area) 是指暴露于液体流或空气流的可用于过滤的过滤介质总面积,通常以平方厘米 (cm2) 、平方英寸 (in2) 或平方英尺 (ft2) 表示。
与澄清的流体相比,颗粒浓度较高的流体会更快地堵塞过滤器。此时,提高有效过滤面积可以延长过滤器的使用寿命。即过滤体积越大,所需的滤器直径越大。但在选择滤器时,不单要注意过滤体积,还要留意滤器自身带来的滞留体积的影响。在处理成本高昂或异常珍贵的流体时,建议使用滞留体积低的过滤器。样品体积、有效过滤面积 (EFA) 与滞留体积之间的关系参考如下:
注:样品实际过滤体积,受样品性质影响,如样品类型、粘稠度和颗粒物含量等。
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