KTA蛋白层析系统延迟体积的确定与设置
?KTA蛋白层析系统的流路自身包含一定管路体积,这部分管路体积又称为延迟体积。延迟体积依据位置不同可以分为梯度延迟体积和收集延迟体积,本文将对以上两种延迟体积定义、延迟体积确定方法和UNICORN系统中延迟体积的设置进行详细介绍。
梯度延迟体积(Gradient delay volume)
梯度延迟体积是指设置梯度程序时混合池与层析柱入口之间的体积,这部分管路体积会导致层析柱中真实梯度与程序中的梯度 (%B curve) 出现一定的延迟(图1)。梯度延迟体积可以通过理论计算和实验测定的方法获得,在使用特定混合器的层析系统中梯度延迟体积是一个定值,不会随着使用层析柱体积大小发生改变。对于离子交换等通过拉梯度方式进行洗脱的层析方法,进行梯度优化时尤其要注意,样品洗脱峰对应B%浓度,是此时混合池正在混合的梯度,并非样品被洗脱当时进入柱子的B%盐浓度。此时,可以用开始给混合池梯度命令(绿色线起点)和电导检测器检测到电导值开始增加(蓝色线起点)之间的体积差,近似作为梯度延迟体积,用于倒推样品洗脱时对应的B%浓度。
图1. 真实梯度(蓝色)对比程序梯度(绿色)
收集延迟体积(Fraction delay volume)
?KTA系统收集延迟体积指UV检测器到样品收集器或者UV检测器与outlet之间管路的体积(图2)。
图2. 蛋白层析系统?KTA系统延迟示意图
?KTA蛋白层析系统收集样品时,需要在系统中准确设置收集延迟体积,从而避免因为收集延迟体积错误,造成?KTA紫外峰图显示的样品出峰位置与对应的收集管发生错位的现象(图3)。图3中(a)图没有收集设置延迟体积导致SDS-PAGE胶图与UV峰图相比出现滞后现象;而(b)图中准确设置收集延迟体积,SDS-PAGE胶图与UV峰图可以较好的进行对应[1]。
图3. 系统延迟体积设置对收集位置的影响[1]
收集延迟体积确定方法
系统延迟体积可以通过理论计算和实验测定的方法进行确定,以下将对两种延迟体积确定方法分别进行介绍。
收集延迟体积理论计算方法
理论计算是获得延迟体积较简便方便的方法,延迟体积理论计算包括以下3个步骤:
1
确定设备系统流路中所有成分部件。
2
查表确定系统流路中各个硬件单元(?KTA pure User Manual 9.14章节)和单位长度管路对应体积(表1)。
3
计算系统延迟体积:将混合池体积与连接层析柱管路体积相加即获得梯度延迟体积;将UV检测器样品流通池的1/2体积(UV检测器检测点为流通池中心区域)与流路中其它硬件与管路的体积进行加和,得到收集延迟体积。
表1. ?KTA系统不同内径管路应用及单位长度管路内部体积
收集延迟体积的实验测定方法
UV吸收值测定法
连接F9-R和F9-T收集器的?KTA pure系统(图3)可以通过UV吸收值测定的方法得到,通过测定V1(样品入口与UV检测器之间体积)、V2(样品入口到收集器样品出口端之间的体积),计算V2-V1+1/2V(V为UV检测器流通池体积)获得延迟体积[2][3]。具体实验步骤如下:
1
设置系统流速1 ml/min(如果流速不准确,检查系统泵是否进气,继续实验前确定流速的准确性)。
2
使用1%-5%丙酮溶液充满样品环(例:样品体积100 μl)。
3
设置UV检测器到收集器之间所有部件为bypass模式。
4
用水充满系统管路,设置流速1 ml/min,用样品环中丙酮溶液为样品上样。
5
计算从样品注入点开始到层析图谱紫外吸收最高点流路体积,即为V1。
6
重新配置系统流路,将收集器置于UV检测器之前。断开UV检测器两端管路,用死体积较小的连接头将两端管路连接起来。收集器出口管路连入UV检测器,UV检测器出口端接入废液口Waste。
7
设置一个较大的收集体积(比如100 ml),保证实验过程中样品从收集口流出。
8
设置流速1 ml/min,加入样品丙酮溶液。
9
计算从样品注入点开始到层析图谱紫外吸收最高点流路体积,即为V2。
10
依据公式计算V2-V1+1/2V(V为UV检测器流通池体积),获得延迟体积。
图4. (A) ?KTA pure蛋白层析系统(B)F9-R收集器(C)F9-T收集器
称重法
通过称量水的重量测定收集延迟体积(容器重量需要预先称重)[3]。
1
设置系统流路从UV流通池直接流向收集器。
2
用鲁尔接头替换UV检测器入口接管。
3
用注射器将UV流通池到收集器尖端整个管路用水充满。
4
使用注射器用空气将UV流通池到收集器尖端整个管路中的水完全替换出来。
5
通过称量水的重量测定收集延迟体积。
6
重复3次实验取平均值。
标准配置的?KTA pure收集延迟体积
标准配置、使用标准长度管路的?KTA pure设备,其设备标准延迟体积数据已在?KTA pure使用手册中列出。手册中延迟体积数据是依据U9-M紫外检测器计算,如果使用U9-L紫外检测器需要在此体积基础上加9μl (2mm流通池)、4μl(5mm流通池)。
标准配置?KTA pure Micro/Micro kit配置微量紫外检测器、微量电导检测器和微量出口阀。
标准配置的?KTA pure系统可以通过查询对应表格(表2、表3和表4)得到标准配置设备收集延迟体积信息。
其他型号标准配置的?KTA蛋白层析系统也可以通过查询使用手册获得设备标准收集延迟体积。
表2. ?KTA pure25收集延迟体积
表3. ?KTA pure Micro/Micro kit收集延迟体积
表4. ?KTA pure 150收集延迟体积
UNICORN系统中收集延迟体积的设置
UNICORN系统中可以设置UV检测器到Outlet阀及UV检测器到收集器之间的延迟体积(图4),具体设置步骤如下:
1
在System Control界面选择System-Settings,打开System Settings对话框。
2
点击 Fraction collection →Delay volumes。
3
在Detector-Frac 中输入UV检测器到收集器之间的延迟体积数值;在 Detector – Outlet中输入UV检测器到出口阀之间的延迟体积数值。
图4. UNICORN系统延迟体积的设置界面
需要说明的是不同型号的?KTA蛋白层析系统延迟体积的确定和设置方法,操作细节上可能存在细微差别,具体设置方法可以查看对应型号产品的使用手册。
参考文献:
1. 芦亚菲. 《蛋白质制备与鉴定平台蛋白层析系统介绍》清华大学蛋白质研究技术中心蛋白质制备与鉴定平台 2020/05/16 https://phoenix.tsinghua.edu.cn/index.php?c=show&id=519
2. ?KTA pure User Manual 29119969 AE
3. ?KTA Laboratory-scale Chromatography Systems CY13989-02Dec20-HB. Appendix 3 Determination of delay volumes
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