高通量测序NGS助手—Feyond-F100荧光酶标仪
文库的质量对于高通量测序(NGS)产出的数据质量至关重要,低估或高估文库质量都会严重影响测序的效果。目前,最常用的定量试剂,是以Picogreen为主要成分的荧光染料,当其与DNA双链结合后,才能发出荧光,且所产生的荧光在一定范围内与DNA浓度呈正比,从而起到对DNA样本的精准定量。
与这类试剂搭配最常见的仪器,应是荧光计和荧光酶标仪。常见的荧光计有Thermo的Qubit4和Qubit Flex,还有奥盛自有产品Fluo-200和Fluo-800,但荧光计的通量较少,最多只能做到8通道,若要同时进行8通道的样品检测,还需同时进行8通道的标品校准,非常浪费试剂。而选用荧光酶标仪作为检测工具时,虽然检测通量有所增大,但面临着标准曲线建立的问题,由于荧光染料受环境的影响较大,因此在每次进行样品检测时,都需要重新建立一条标准曲线,若标曲线性不够理想,还需重新配制标曲,增加实验负担。
奥盛Feyond-F100荧光酶标仪不仅可进行常规的细胞活性、GFP、RFP、ORAC、Ca2+流分析等荧光实验,新增的定量检测功能集荧光计的便利与酶标仪的高通量于一身,无需建立标准曲线,仅需校准标品点,即可实现96个样品的精确定量,最低检出限达0.1ng/uL(10uL样本量)。
特色功能
除常规荧光检测外,新增定量模式
图1 Feyond-F100主界面图
仅需布局两个标品点,即可完成曲线校准
图2 标准品校准界面
内置标曲,调用即可,也可自行建立曲线保存
图3 标准曲线界面
仅需输入样品体积,检测结果一目了然
图4 结果显示界面
性能优异
标品性能验证
将10ng/uL标品梯度稀释成8、6、4、2、1、0.4、0.2ng/uL。样本量为1uL或10uL时,Feyond-F100与Q的偏差均在10%以内。
表1 标准品检测结果
体积 | 样品类型 | Q定量 | Feyond-F100 | 差值 | 偏差 |
10 | 标品 | 0.189 | 0.1941 | -0.0051 | -2.7% |
10 | 标品 | 0.378 | 0.3854 | -0.0074 | -2.0% |
10 | 标品 | 0.982 | 0.9739 | 0.0081 | 0.8% |
10 | 标品 | 1.93 | 1.9675 | -0.0375 | -1.9% |
10 | 标品 | 4 | 4.0883 | -0.0883 | -2.2% |
10 | 标品 | 5.94 | 6.0796 | -0.1396 | -2.4% |
10 | 标品 | 7.78 | 7.8077 | -0.0277 | -0.4% |
10 | 标品 | 10.2 | 10.0803 | 0.1197 | 1.2% |
1 | 标品 | 1.03 | 1.095 | -0.065 | -6.3% |
1 | 标品 | 1.92 | 1.997 | -0.077 | -4.0% |
1 | 标品 | 4.1 | 4.12 | -0.02 | -0.5% |
1 | 标品 | 6.18 | 6.043 | 0.137 | 2.2% |
1 | 标品 | 8.14 | 7.895 | 0.245 | 3.0% |
1 | 标品 | 10.5 | 10.059 | 0.441 | 4.2% |
文库及核酸定量
在测试文库样本及cfDNA样本时,Feyond-F100与Q的偏差也可在10%以内。
表2 样品检测结果
体积 | 样品类型 | Q定量 | Feyond-F100 | 差值 | 偏差 |
1 | 文库 | 104 | 105.079 | -1.079 | -1.0% |
1 | 文库 | 74.2 | 74.102 | 0.098 | 0.1% |
1 | 文库 | 77.4 | 75.628 | 1.772 | 2.3% |
1 | 文库 | 22.6 | 22.245 | 0.355 | 1.6% |
1 | 文库 | Out of range | 148.53 | / | / |
1 | 文库 | 52.4 | 53.455 | -1.055 | -2.0% |
1 | 文库 | 84.6 | 87.402 | -2.802 | -3.3% |
1 | 文库 | 11.5 | 10.8 | 0.7 | 6.1% |
2 | cfDNA | 0.456 | 0.482 | -0.026 | -5.7% |
2 | cfDNA | 1.27 | 1.287 | -0.017 | -1.3% |
2 | cfDNA | 0.625 | 0.622 | 0.003 | 0.5% |
2 | cfDNA | 0.758 | 0.794 | -0.036 | -4.7% |
2 | cfDNA | 1.45 | 1.522 | -0.072 | -5.0% |
2 | cfDNA | 1.48 | 1.542 | -0.062 | -4.2% |
注:上述实验数据来源奥盛实验室
关于奥盛
奥盛定位生命科学工具提供商,专注生命科学检测设备及自动化解决方案。公司围绕生物样品核酸蛋白纯化、自动化工作站,生物吸收光、荧光及发光检测三大技术平台,在生命科学领域进行了深度布局。
目前,公司拥有省级高新技术企业研究院,是2022年第一批浙江省”专精特新”中小企业。
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