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快速分型 | IR Biotyper用于ST-72型金黄色葡萄球菌食物中毒事件的调查

来源：布鲁克（北京）科技有限公司分类：促销 2024-04-03 18:15:08 124阅读次数

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警惕春季美食

食物中毒

进入春季，尤其是清明假期，随着气温的逐渐升高，各种春季食物也开始陆续上市，为人们带来了丰富的味蕾享受。然而，在享受美食的同时，我们也要特别注意食品安全问题，其中，除了之前我们介绍过的李斯特菌和沙门氏菌等食源性细菌，还要警惕金黄色葡萄球菌的污染。

金黄色葡萄球菌是一种常见的细菌，它可以在多种食物中生长繁殖，并产生有毒的肠毒素。一旦食用了被金黄色葡萄球菌污染的食物，就可能引发食物中毒，症状包括恶心、呕吐、腹痛、腹泻等，严重情况下甚至可能危及生命。

春季是食物易于变质和细菌滋生的季节，因为温暖湿润的环境为细菌提供了良好的生长条件。因此，在这个时期，我们更需要加强食品安全意识，采取一系列有效的措施来预防金黄色葡萄球菌等细菌的污染。

葡萄球菌食物中毒 / 知多少

葡萄球菌食物中毒（SFP）是世界范围内食源性中毒最普遍的原因之一，是由于摄入葡萄球菌肠毒素（SEs）引起的。它是由以金黄色葡萄球菌为代表的凝固酶阳性葡萄球菌的产肠毒素菌株产生的一类耐热蛋白。虽然葡萄球菌导致的食物中毒一般是自限性的，但在短暂潜伏期后可能会出现严重的呕吐、腹泻、腹痛或恶心症状。金黄色葡萄球菌还可能引起严重感染、中毒和致命的疾病，包括皮肤和软组织感染、中毒性休克和败血症。

IR Biotyper助力食物中毒调查

2019年8月，意大利某养老院发生了一起食物中毒事件。经过流行病学调查，发现共有69人参与了午餐，其中33人食用了鸡肉沙拉，值得注意的是，在这33人中，有11人随后出现了食物中毒的症状。由于其余36人没有食用鸡肉沙拉，因此鸡肉沙拉成为最有可能的暴发源。

表1. 涉疫人员的信息概要

实验室检查

本实验共从七个样本中分离出金黄色葡萄球菌，包括1个呕吐物、2个食物（鸡肉沙拉加及不含蛋黄酱）样本，以及从四名在养老院工作的食物制作人员采集的鼻拭子。为确保对菌株的遗传特性和传播路径有深入的了解，进一步对每个阳性样品中进行了单核苷酸多态性（SNP）分析、多位点序列分型（MLST）和IR Biotyper微生物红外光谱分型系统 (IRBT)进行分析。

表2. 金黄色葡萄球菌阳性样本的信息概要

进一步分析显示，从7份样本中分离出的金黄色葡萄球菌，这些菌株具有相同的耐药基因、肠毒素基因和ST型，仅3号食物制作人员的鼻拭子中的两个菌株肠毒素基因有所不同。这些结果强烈提示金黄色葡萄球菌是此次食物中毒事件的主要病原体，且食物制作人员可能是污染源之一。

图1. 使用CSI Phylogeny 1.2软件的SNP分析获得的最大似然树。显示从食物制作人员的鼻拭子（O1）、患者的呕吐物样本（P1）和含/不含蛋黄酱的鸡肉沙拉食物样本（F1/F2）中分离的菌株之间基因相似度高，而与其它菌株（O2、O3和O4）基因相似度低。

IR Biotyper快速获得分型溯源结果

布鲁克IR Biotyper 微生物红外光谱分型系统分析显示，分离于病人呕吐物、两种鸡肉沙拉和1号食物制作人员的4份标本的菌株聚在一簇，亲缘关系很近，这与SNP分析的结果一致，MLST分析表明这4个菌株都属于ST-72型，毒素基因和耐药基因的检测结果也一致。此外，IRBT可以很好地区分来自3号食物制作人员鼻拭子的有/无肠毒素基因（seg和sei）的两个ST-22型菌株（O3-1和O3-2），表现出比MLST更高的分辨率。

图2. IRBT聚类分析的树状图

图3. LDA分析的三维散点图

小结

根据以上流行病学调查和实验室检查的结果，可以推断此次疫情是由1号食物制作人员引起的，其作为ST-72型金黄色葡萄球菌的无症状携带者，可能因未遵守良好的卫生习惯而在制作食物的过程中污染了鸡肉沙拉，进而传染给其他人。

本文用包括IR Biotyper 微生物红外光谱分型系统在内的多种方法分析了一起因病原菌无症状携带者污染食物而引起的ST-72型金黄色葡萄球菌传播疫情，说明了实验室证据和流行病学数据对疫情调查的重要性。本文也进一步证明，IRBT和WGS的菌株分型能力相当，虽然WGS提供的信息更多，但IRBT操作方便，样品处理简单，分析速度快，分析成本低，报告时间短，所需样品量少，特别适用于快速实时的疫情调查和日常的卫生管理和监测。

温馨提示 ●●●

春季是享受美食的好时节，但我们也要时刻关注食品安全问题。通过选购新鲜食材、注意食品保存、彻底清洁食材、烹饪食物至熟透以及注意个人卫生等措施，有效预防金黄色葡萄球菌的污染和食物中毒的发生，确保自己和家人的健康。

参考文献：

Federica Savini, Angelo Romano, Federica Giacometti, Valentina Indio, Monica Pitti, Lucia Decastelli, Pietro Luigi Devalle, Ilaria Silvia Rossella Gorrasi.Investigation of a Staphylococcus aureus sequence type 72 food poisoning outbreak associated with food-handler contamination in Italy.Published in Zoonoses and Public Health 10 May 2023. https://doi.org/10.1111/zph.13046

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